Omenapuita voi kasvattaa kaupasta saatavien taimien lisäksi myös siemenistä. Suurin osa kaupallisista omenapuiden taimista on hybridilajikkeita, joiden siemenistä kasvavat puut eivät yleensä tuota samanlaisia hedelmiä kuin kasvi, josta siemenet ovat lähtöisin. Parhaimmillaan itse siemenestä kasvatettu puu tuottaa kuitenkin hyvinkin herkullisia hedelmiä, ja huonoimmillaankin siitä saa ainakin arvokasta puuainesta - omenapuu on erittäin kovaa ja kestävää puuta ja ihanteellista esimerkiksi jousien tekoon.
Siemeniä saa helpoiten kaupan omenoista tai jostain puutarhassa kasvavasta omenapuusta. Kaupan omenoiden tapauksessa siemenet tuottaneeksi lajikkeeksi kannattaa valikoida jokin kotimainen hyvin pakkasta kestävä lajike ja suosia kotimaassa tuotettuja hedelmiä siementen lähteenä.
Omenapuut ovat hieman hankalia idätettäviä, koska siemenet tarvitsevat itääkseen melko paljon kosteutta, mutta itämisen jälkeen taimet ovat hyvin herkkiä juurimädälle ja siinä vaiheessa mullan pitäisikin melko nopeasti muuttua hyvin kuivaksi. Hieman varttuneemmatkin taimet ottavat suuren osan tarvitsemastaan kosteudesta ilmasta ja liian kostea multa häiritsee ravinteiden ottoa aiheuttaen muun muassa sinkin puutosta. Multa ei myöskään saisi olla kovin hapanta, mutta ei myöskään kovin ravinteikasta ainakaan taimivaiheessa olevalle kasville. Väitetysti siemenet tarvitsevat jonkinlaisen kylmäkäsittelyn ennen idättämistä, mutta oman kokemukseni mukaan se ei ole välttämätöntä.